Для того, чтобы в программе 1С:Бухгалтерия 2.0 сотруднику отключить начисление страховых взносов, нужно создать для сотрудника новый вид начисления (меню Зарплата - Сведения о начислениях - Начисления), например, Авторский, и указать в поле Страховые взносы: Доходы, не являющиеся объектом обложения страховыми взносами, а в поле ФСС: Не облагается.